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办公室(党委办公室):承担党务、综合政务、公文与印章、网络安全与信息化、安全生产、平安单位建设、新闻宣传、保密、档案、人事管理、纪检、信访、统战、离退休、后勤等管理工作。
科研计划财务处:承担科技创新、计划经营、资质、成果质量、资产、财务、审计等管理工作。
规划与法规研究中心:水资源保护规划编制;流域(区域)综合规划、有关专业或专项规划的水资源保护与水生态环境保护规划、规划环评编制;生态流量水量管理与保障、饮用水水源地保护、地下水资源管理保护研究,以及水利水电工程环境影响、流域保护相关重大问题研究;流域内生活、生产经营和生态环境用水调查与评价;水功能区划分与调整、纳污能力核算、水资源承载能力、水资源刚性约束等水资源保护相关理论与应用研究;水资源保护相关法规政策、管理制度、技术规范标准研究与起草。
环境水利研究中心:流域水资源保护相关信息采集、管理及应用研究;水利水电工程等建设项目环境影响论证、环境保护措施研究与设计;水利水电工程环境保护相关技术标准研究;流域(区域)开发环境影响论证与跟踪评价,水利水电工程建设环境影响后评估;河湖生态保护治理、水系连通、湿地及岸线保护与修复相关理论与关键技术研究;水资源与水环境保护相关理论与关键技术研究;水利水电工程规划、勘测设计、建设与运行管理过程中生态环境保护研究与技术咨询。
水生态环境研究中心(流域水环境实验室):水资源质量调查评价,水污染预警与应急处置,以及水质安全保障与风险防范技术研究;非常规水资源化利用研究;流域水文水质模型研发与水利数字孪生研究;水生态调查与评估,生态水文模拟与生态调度,以及水生态保护与修复技术研究;规划与建设项目水资源论证,入河排污口设置论证;水生态环境保护相关新技术引进、示范与推广、指导与培训,流域水环境实验室等科研平台运行管理。
节约与保护工程技术研究中心:流域内计划用水和节约用水、取用水定额、节水评价等技术工作,以及国家节水行动实施有关具体工作;水利水电工程建设与运行管理、验收等过程中的环境保护研究与技术咨询;涉水工程水文分析计算及防洪影响分析评价;水土保持规划编制,水土保持监测与监管技术研究,以及建设项目水土保持相关技术工作;节水与水土保持等新技术引进、示范与推广、指导与培训;水资源保护工程体系建设与关键技术研发,以及环境保护工程技术研发。
长江水资源保护科技咨询有限公司:长江水资源保护科学研究所下属全资企业,主要开展建设项目环评、水土保持方案编制、环境保护设计、环境保护监理、生态调查等业务。下设武汉长护源环保科技有限公司、武汉市天彩印务有限责任公司两个子公司。
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